Zranione ptaki to historia o siostrze, której miłość chroni rodzeństwo przed wszelkim złem. Meryem jest młodą, silną i piękną kobietą, los sprawił, że przez ostatnie pięć lat wychowuje swojego młodszego brata Ömera. Kiedy była nastolatką, ktoś dał dziecko jej ojcu Durmusowi. Ten zamierzał je sprzedać, jednak został wcześniej aresztowany. Teraz kobieta ciężko pracuje, aby mały Ömer nie trafił na ulicę. Dowiaduje się, że jej przyszywany brat jest synem wpływowego przemysłowca i został porwany w walce o władzę nad imperium rodzinnym. Mayrem pragnie połączyć Ömera z jego biologiczną rodziną.
Zranione ptaki - odcinek 1
Meryem to piękna i dobra dziewczyna. Pracuje w portowej kawiarni i samotnie wychowuje przybranego braciszka Ömera. Pewnego dnia niespodziewanie pojawia się Durmuş, ojciec Meryem, który właśnie wyszedł z więzienia. Powrót ojca oznacza dla Meryem koniec skromnego, ale spokojnego życia. Już pierwszego dnia mężczyzna robi awanturę, w rezultacie której zamyka Meryem i Ömera w pokoju. Przy okazji Durmuş przypomina Meryem, że chłopiec nie jest jej rodzonym bratem i że pewnego dnia podrzucił mu go znajomy. Po powrocie do domu Durmuş odkrywa talent chłopca do otwierania zamków i zamierza to wykorzystać. Siostra Durmuşa, Neriman, pracuje dla mężczyzny imieniem Tekin i nadzoruje grupę małych sierot (tytułowych Ptaków) zmuszanych do pracy na ulicy.
Ulviye to seniorka bogatej rodziny. Mieszka w pięknej rezydencji razem ze swoim starszym synem – Bahadırem i jego żoną Hülyą, która całkowicie podporządkowała sobie męża. Obie kobiety nie darzą się zbytnią sympatią. Nagle Ulviye zaczyna mieć problemy ze zdrowiem. Prosi Bahadıra, aby wezwał do domu swojego młodszego brata – Leventa. Hülya nie jest tym zachwycona. Okazuje się jednak, że Ulviye udaje chorobę, żeby skłonić syna do powrotu do domu. Jedyną powierniczą jej sekretu jest zaufana służąca Aysel. Nagłe pogorszenie się stanu zdrowia teściowej budzi podejrzenia Hülyi.
Zranione ptaki - odcinek 2
Na wieść o chorobie matki Levent postanawia ją odwiedzić. Jednak tragiczne wydarzenia z przeszłości, kiedy to stracił ukochaną żonę i małego synka, sprawiają, że pobyt w domu jest dla niego torturą. W tym samym czasie służąca Aslı, córka Aysel, nabiera pewności, że Ulviye tylko udaje problemy ze zdrowiem i dzieli się swoimi spostrzeżeniami z Hülyą. Meryem ma żal do ojca za jego zachowanie. Ten natomiast próbuje przekabacić ją i Ömera. Mężczyzna nie ma jednak dobrych intencji, namawia Tekina, żeby wykorzystać zdolności chłopca i obrabować łódź cumującą w marinie, traf chce, że to łódź Leventa. Przeprowadzenie planu ułatwia nieobecność Meryem, która przyjmuje na wieczór dodatkową pracę. Tymczasem w rezydencji pojawia się wezwany przez Hülyę lekarz, który demaskuje fortel Ulviye.
Zranione ptaki - odcinek 3
Meryem wraca do domu wcześniej i zauważa nieobecność ojca i Ömera. Zaniepokojona rusza na ich poszukiwanie. Dzięki informacjom od jednego z dzieci pracujących dla Tekina dowiaduje się o planie okradzenia łodzi w przystani. Durmuş i Neriman przywożą dzieci do mariny. Durmuş, pod pretekstem zabawy w piratów, przekonuje Ömera, by razem z Błotnikiem weszli na łódź i zabrali z niej skarb. Levent nie może sobie wybaczyć, że nie był w stanie odnaleźć porwanego synka. Jest wściekły na matkę za to, że zwabiła go do domu udając chorą. Ku rozpaczy Ulviye i radości Hülyi, mężczyzna postanawia wypłynąć następnego dnia rano. Meryem i Levent pojawiają się na przystani niemal jednocześnie. Meryem udaje się odnaleźć Ömera i zanim Levent orientuje się w sytuacji, udaje im się uciec. Chłopiec zabiera ze sobą szkatułkę, którą znalazł na łodzi, w której znajdują się pamiątki po zaginionym synu Leventa. Drogę ucieczki zastępuje im Durmuş. Ömer stanowczo sprzeciwia się oddaniu ojcu szkatułki. Rodzeństwu ponownie udaje się uciec. Postanawiają zwrócić szkatułkę właścicielowi i wyjechać gdzieś, gdzie będą mogli rozpocząć nowe życie. O tajemniczej szkatułce dowiaduje się też Tekin. Mężczyzna za wszelką cenę chce odnaleźć Durmuşa, Meryem i Ömera, których obwinia za niepowodzenie akcji, i odebrać im szkatułkę. Ulviye nie posiada się z radości, gdy w drzwiach rezydencji pojawia się Levent. Mężczyzna postanawia zostać do czasu wyjaśnienia sprawy kradzieży.
